Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
ZFHX3Q15911 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
ZFHX3Q15911 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
ZFHX3Q15911 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
ZFHX3Q15911 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
ZFHX3Q15911 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
ZFHX3Q15911 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
ZFHX3Q15911 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
ZFHX3Q15911 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
ZFHX3Q15911 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
ZFHX3Q15911 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
ZFHX3Q15911 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.07
ZFHX3Q15911 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-4.22□□□□□ -3.08
ZFHX3Q15911 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
ZFHX3Q15911 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
ZFHX3Q15911 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
ZFHX3Q15911 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
ZFHX3Q15911 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
ZFHX3Q15911 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-4.26□□□□□ -3.09
ZFHX3Q15911 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
ZFHX3Q15911 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
ZFHX3Q15911 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
ZFHX3Q15911 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
ZFHX3Q15911 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
ZFHX3Q15911 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
ZFHX3Q15911 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
ZFHX3Q15911 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
ZFHX3Q15911 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ZFHX3Q15911 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
ZFHX3Q15911 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
ZFHX3Q15911 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
ZFHX3Q15911 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-4.38□□□□□ -3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms