Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GPNMBQ14956 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
GPNMBQ14956 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
GPNMBQ14956 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
GPNMBQ14956 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GPNMBQ14956 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
GPNMBQ14956 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
GPNMBQ14956 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
GPNMBQ14956 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GPNMBQ14956 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GPNMBQ14956 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GPNMBQ14956 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GPNMBQ14956 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GPNMBQ14956 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GPNMBQ14956 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
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GPNMBQ14956 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
GPNMBQ14956 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
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GPNMBQ14956 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
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GPNMBQ14956 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
GPNMBQ14956 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
GPNMBQ14956 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
GPNMBQ14956 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
GPNMBQ14956 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
GPNMBQ14956 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
GPNMBQ14956 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
GPNMBQ14956 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
GPNMBQ14956 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.64□□□□□ -2.67
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GPNMBQ14956 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
GPNMBQ14956 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
GPNMBQ14956 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
GPNMBQ14956 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
GPNMBQ14956 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
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