Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
IRF3Q14653 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
IRF3Q14653 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
IRF3Q14653 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
IRF3Q14653 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
IRF3Q14653 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
IRF3Q14653 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.7 ms