Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
UBE4AQ14139 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
UBE4AQ14139 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
UBE4AQ14139 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
UBE4AQ14139 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
UBE4AQ14139 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBE4AQ14139 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBE4AQ14139 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
UBE4AQ14139 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
UBE4AQ14139 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
UBE4AQ14139 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
UBE4AQ14139 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
UBE4AQ14139 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
UBE4AQ14139 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
UBE4AQ14139 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
UBE4AQ14139 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
UBE4AQ14139 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
UBE4AQ14139 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
UBE4AQ14139 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBE4AQ14139 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
UBE4AQ14139 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
UBE4AQ14139 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
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UBE4AQ14139 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
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UBE4AQ14139 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
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UBE4AQ14139 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
UBE4AQ14139 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
UBE4AQ14139 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
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UBE4AQ14139 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
UBE4AQ14139 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
UBE4AQ14139 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
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UBE4AQ14139 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
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UBE4AQ14139 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
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UBE4AQ14139 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
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UBE4AQ14139 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
UBE4AQ14139 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
UBE4AQ14139 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
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UBE4AQ14139 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
UBE4AQ14139 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
UBE4AQ14139 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
UBE4AQ14139 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
UBE4AQ14139 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
UBE4AQ14139 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
UBE4AQ14139 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
UBE4AQ14139 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
UBE4AQ14139 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
UBE4AQ14139 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
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