Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
COL4A6Q14031 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-3.83□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
COL4A6Q14031 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
COL4A6Q14031 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
COL4A6Q14031 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
COL4A6Q14031 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
COL4A6Q14031 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
COL4A6Q14031 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
COL4A6Q14031 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
COL4A6Q14031 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
COL4A6Q14031 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
COL4A6Q14031 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
COL4A6Q14031 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
COL4A6Q14031 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
COL4A6Q14031 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
COL4A6Q14031 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.06
COL4A6Q14031 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
COL4A6Q14031 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
COL4A6Q14031 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
COL4A6Q14031 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
COL4A6Q14031 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
COL4A6Q14031 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
COL4A6Q14031 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
COL4A6Q14031 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
COL4A6Q14031 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
COL4A6Q14031 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
COL4A6Q14031 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-4.13□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-4.15□□□□□ -3.07
COL4A6Q14031 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
COL4A6Q14031 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
COL4A6Q14031 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
COL4A6Q14031 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
COL4A6Q14031 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
COL4A6Q14031 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
COL4A6Q14031 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
COL4A6Q14031 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
COL4A6Q14031 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
COL4A6Q14031 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
COL4A6Q14031 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.09
COL4A6Q14031 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
COL4A6Q14031 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
COL4A6Q14031 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
COL4A6Q14031 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms