Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
CACNA1SQ13698 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CACNA1SQ13698 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CACNA1SQ13698 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CACNA1SQ13698 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CACNA1SQ13698 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CACNA1SQ13698 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CACNA1SQ13698 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CACNA1SQ13698 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CACNA1SQ13698 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CACNA1SQ13698 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CACNA1SQ13698 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CACNA1SQ13698 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CACNA1SQ13698 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CACNA1SQ13698 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CACNA1SQ13698 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
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