Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
CDC42SE2Q9NRR3 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
CDC42SE2Q9NRR3 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
CDC42SE2Q9NRR3 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
CDC42SE2Q9NRR3 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-4.19□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-4.26□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
CDC42SE2Q9NRR3 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CDC42SE2Q9NRR3 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CDC42SE2Q9NRR3 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
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