Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
BEST4Q8NFU0 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
BEST4Q8NFU0 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
BEST4Q8NFU0 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
BEST4Q8NFU0 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
BEST4Q8NFU0 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BEST4Q8NFU0 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BEST4Q8NFU0 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
BEST4Q8NFU0 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
BEST4Q8NFU0 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
BEST4Q8NFU0 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
BEST4Q8NFU0 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
BEST4Q8NFU0 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
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BEST4Q8NFU0 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
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BEST4Q8NFU0 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
BEST4Q8NFU0 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
BEST4Q8NFU0 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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BEST4Q8NFU0 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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BEST4Q8NFU0 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
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BEST4Q8NFU0 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
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BEST4Q8NFU0 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
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BEST4Q8NFU0 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
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BEST4Q8NFU0 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BEST4Q8NFU0 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BEST4Q8NFU0 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BEST4Q8NFU0 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
BEST4Q8NFU0 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
BEST4Q8NFU0 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
BEST4Q8NFU0 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
BEST4Q8NFU0 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
BEST4Q8NFU0 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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