Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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USP49Q70CQ1 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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USP49Q70CQ1 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
USP49Q70CQ1 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
USP49Q70CQ1 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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USP49Q70CQ1 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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USP49Q70CQ1 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USP49Q70CQ1 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
USP49Q70CQ1 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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USP49Q70CQ1 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
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USP49Q70CQ1 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
USP49Q70CQ1 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
USP49Q70CQ1 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
USP49Q70CQ1 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
USP49Q70CQ1 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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