Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CCDC96Q2M329 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CCDC96Q2M329 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CCDC96Q2M329 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CCDC96Q2M329 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CCDC96Q2M329 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CCDC96Q2M329 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CCDC96Q2M329 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
CCDC96Q2M329 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
CCDC96Q2M329 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CCDC96Q2M329 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC96Q2M329 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CCDC96Q2M329 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CCDC96Q2M329 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CCDC96Q2M329 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CCDC96Q2M329 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CCDC96Q2M329 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CCDC96Q2M329 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CCDC96Q2M329 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
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CCDC96Q2M329 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
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CCDC96Q2M329 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
CCDC96Q2M329 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CCDC96Q2M329 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CCDC96Q2M329 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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CCDC96Q2M329 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CCDC96Q2M329 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
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CCDC96Q2M329 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CCDC96Q2M329 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
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CCDC96Q2M329 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CCDC96Q2M329 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CCDC96Q2M329 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CCDC96Q2M329 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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