Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
CDKN3Q16667 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CDKN3Q16667 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CDKN3Q16667 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CDKN3Q16667 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CDKN3Q16667 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.2 ms