Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SNRNP35Q16560 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SNRNP35Q16560 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SNRNP35Q16560 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SNRNP35Q16560 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.13□□□□□ -2.75
SNRNP35Q16560 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.1 ms