Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
NEDD8Q15843 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
NEDD8Q15843 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.41□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-3.43□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
NEDD8Q15843 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-3.53□□□□□ -2.97
NEDD8Q15843 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
NEDD8Q15843 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
NEDD8Q15843 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
NEDD8Q15843 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
NEDD8Q15843 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
NEDD8Q15843 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
NEDD8Q15843 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
NEDD8Q15843 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
NEDD8Q15843 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
NEDD8Q15843 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
NEDD8Q15843 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
NEDD8Q15843 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms