Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GBX1Q14549 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
GBX1Q14549 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
GBX1Q14549 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
GBX1Q14549 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
GBX1Q14549 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
GBX1Q14549 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
GBX1Q14549 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
GBX1Q14549 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
GBX1Q14549 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms