Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CACNA1SQ13698 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
CACNA1SQ13698 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CACNA1SQ13698 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CACNA1SQ13698 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CACNA1SQ13698 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
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