Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATRQ13535 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATRQ13535 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ATRQ13535 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ATRQ13535 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ATRQ13535 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
ATRQ13535 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATRQ13535 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ATRQ13535 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ATRQ13535 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATRQ13535 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ATRQ13535 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATRQ13535 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ATRQ13535 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATRQ13535 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATRQ13535 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ATRQ13535 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ATRQ13535 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ATRQ13535 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ATRQ13535 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ATRQ13535 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ATRQ13535 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ATRQ13535 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ATRQ13535 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
ATRQ13535 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
ATRQ13535 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ATRQ13535 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ATRQ13535 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ATRQ13535 RNU6-620P-201ENST00000384017 96 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ATRQ13535 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ATRQ13535 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ATRQ13535 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ATRQ13535 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ATRQ13535 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms