Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
TOP3AQ13472 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TOP3AQ13472 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TOP3AQ13472 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TOP3AQ13472 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TOP3AQ13472 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
TOP3AQ13472 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP3AQ13472 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TOP3AQ13472 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP3AQ13472 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP3AQ13472 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TOP3AQ13472 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TOP3AQ13472 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TOP3AQ13472 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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TOP3AQ13472 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
TOP3AQ13472 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP3AQ13472 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP3AQ13472 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
TOP3AQ13472 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
TOP3AQ13472 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
TOP3AQ13472 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TOP3AQ13472 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP3AQ13472 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP3AQ13472 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TOP3AQ13472 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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TOP3AQ13472 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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TOP3AQ13472 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TOP3AQ13472 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TOP3AQ13472 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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TOP3AQ13472 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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TOP3AQ13472 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TOP3AQ13472 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TOP3AQ13472 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TOP3AQ13472 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TOP3AQ13472 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TOP3AQ13472 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TOP3AQ13472 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TOP3AQ13472 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TOP3AQ13472 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TOP3AQ13472 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TOP3AQ13472 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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