Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPN13Q12923 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PTPN13Q12923 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.7 ms