Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ACTBP60709 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ACTBP60709 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ACTBP60709 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ACTBP60709 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ACTBP60709 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ACTBP60709 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ACTBP60709 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ACTBP60709 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ACTBP60709 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ACTBP60709 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ACTBP60709 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ACTBP60709 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ACTBP60709 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ACTBP60709 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ACTBP60709 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ACTBP60709 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ACTBP60709 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ACTBP60709 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ACTBP60709 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.73□□□□□ -2.85
ACTBP60709 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ACTBP60709 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
ACTBP60709 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
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ACTBP60709 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ACTBP60709 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ACTBP60709 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ACTBP60709 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
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ACTBP60709 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
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ACTBP60709 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
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ACTBP60709 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ACTBP60709 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
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ACTBP60709 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
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ACTBP60709 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ACTBP60709 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
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ACTBP60709 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
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ACTBP60709 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ACTBP60709 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ACTBP60709 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ACTBP60709 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ACTBP60709 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ACTBP60709 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ACTBP60709 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ACTBP60709 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ACTBP60709 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
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