Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ACTBP60709 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ACTBP60709 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ACTBP60709 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ACTBP60709 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ACTBP60709 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ACTBP60709 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ACTBP60709 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ACTBP60709 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ACTBP60709 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ACTBP60709 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ACTBP60709 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ACTBP60709 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ACTBP60709 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ACTBP60709 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ACTBP60709 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ACTBP60709 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ACTBP60709 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ACTBP60709 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ACTBP60709 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ACTBP60709 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ACTBP60709 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.73□□□□□ -2.85
ACTBP60709 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ACTBP60709 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
ACTBP60709 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ACTBP60709 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ACTBP60709 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ACTBP60709 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ACTBP60709 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ACTBP60709 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ACTBP60709 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ACTBP60709 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ACTBP60709 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.76□□□□□ -2.85
ACTBP60709 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ACTBP60709 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ACTBP60709 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ACTBP60709 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ACTBP60709 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ACTBP60709 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ACTBP60709 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ACTBP60709 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ACTBP60709 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ACTBP60709 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ACTBP60709 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ACTBP60709 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ACTBP60709 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ACTBP60709 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ACTBP60709 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ACTBP60709 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ACTBP60709 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ACTBP60709 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ACTBP60709 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ACTBP60709 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ACTBP60709 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ACTBP60709 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ACTBP60709 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ACTBP60709 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ACTBP60709 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ACTBP60709 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ACTBP60709 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ACTBP60709 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ACTBP60709 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ACTBP60709 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ACTBP60709 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ACTBP60709 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ACTBP60709 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ACTBP60709 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ACTBP60709 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ACTBP60709 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ACTBP60709 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ACTBP60709 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ACTBP60709 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
ACTBP60709 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
ACTBP60709 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ACTBP60709 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ACTBP60709 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ACTBP60709 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ACTBP60709 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ACTBP60709 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ACTBP60709 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ACTBP60709 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ACTBP60709 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ACTBP60709 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ACTBP60709 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ACTBP60709 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ACTBP60709 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ACTBP60709 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.8 ms