Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PGGT1BP53609 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PGGT1BP53609 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PGGT1BP53609 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PGGT1BP53609 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PGGT1BP53609 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PGGT1BP53609 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PGGT1BP53609 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PGGT1BP53609 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PGGT1BP53609 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PGGT1BP53609 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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PGGT1BP53609 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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PGGT1BP53609 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PGGT1BP53609 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PGGT1BP53609 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PGGT1BP53609 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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PGGT1BP53609 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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PGGT1BP53609 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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PGGT1BP53609 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
PGGT1BP53609 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PGGT1BP53609 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PGGT1BP53609 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PGGT1BP53609 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PGGT1BP53609 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PGGT1BP53609 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PGGT1BP53609 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PGGT1BP53609 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
PGGT1BP53609 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PGGT1BP53609 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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