Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPS72Q15906 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPS72Q15906 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPS72Q15906 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPS72Q15906 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPS72Q15906 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPS72Q15906 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPS72Q15906 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPS72Q15906 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPS72Q15906 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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VPS72Q15906 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
VPS72Q15906 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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VPS72Q15906 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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VPS72Q15906 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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VPS72Q15906 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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VPS72Q15906 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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VPS72Q15906 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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VPS72Q15906 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPS72Q15906 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VPS72Q15906 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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