Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
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PTPRKQ15262 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
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PTPRKQ15262 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
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PTPRKQ15262 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
PTPRKQ15262 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
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PTPRKQ15262 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PTPRKQ15262 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRKQ15262 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
PTPRKQ15262 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
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