Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
XRCC4Q13426 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
XRCC4Q13426 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
XRCC4Q13426 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
XRCC4Q13426 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XRCC4Q13426 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XRCC4Q13426 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XRCC4Q13426 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XRCC4Q13426 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
XRCC4Q13426 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.49□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.52□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
XRCC4Q13426 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
XRCC4Q13426 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.65□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
XRCC4Q13426 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
XRCC4Q13426 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
XRCC4Q13426 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
XRCC4Q13426 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
XRCC4Q13426 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
XRCC4Q13426 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
XRCC4Q13426 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
XRCC4Q13426 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
XRCC4Q13426 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
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