Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
E2F1Q01094 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
E2F1Q01094 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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E2F1Q01094 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
E2F1Q01094 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
E2F1Q01094 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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