Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	RNU6-940P-201	ENST00000363433	104 nt	BASIC	-0.69	□□□□□ -2.52
TAF1	P21675	MIR4490-201	ENST00000582647	84 nt	BASIC	-0.69	□□□□□ -2.52
TAF1	P21675	MIR527-201	ENST00000385244	85 nt	BASIC	-0.69	□□□□□ -2.52
TAF1	P21675	RNU6-518P-201	ENST00000516056	96 nt	BASIC	-0.69	□□□□□ -2.52
TAF1	P21675	RNU6-634P-201	ENST00000459134	106 nt	BASIC	-0.7	□□□□□ -2.52
TAF1	P21675	Y_RNA.282-201	ENST00000364793	102 nt	BASIC	-0.71	□□□□□ -2.52
TAF1	P21675	Y_RNA.457-201	ENST00000384237	111 nt	BASIC	-0.71	□□□□□ -2.52
TAF1	P21675	RNA5SP225-201	ENST00000410874	135 nt	BASIC	-0.71	□□□□□ -2.52
TAF1	P21675	RNU6-687P-201	ENST00000516443	89 nt	BASIC	-0.71	□□□□□ -2.52
TAF1	P21675	Y_RNA.236-201	ENST00000364427	111 nt	BASIC	-0.72	□□□□□ -2.52
TAF1	P21675	SCARNA20.2-201	ENST00000516052	116 nt	BASIC	-0.72	□□□□□ -2.52
TAF1	P21675	MIR517B-201	ENST00000385102	67 nt	BASIC	-0.73	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-1250P-201	ENST00000391218	107 nt	BASIC	-0.73	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNA5SP169-201	ENST00000517268	117 nt	BASIC	-0.73	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	Y_RNA.484-201	ENST00000384389	103 nt	BASIC	-0.73	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-24P-201	ENST00000384440	107 nt	BASIC	-0.73	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-246P-201	ENST00000384702	107 nt	BASIC	-0.73	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	Y_RNA.545-201	ENST00000384652	105 nt	BASIC	-0.74	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-696P-201	ENST00000390834	107 nt	BASIC	-0.74	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-1246P-201	ENST00000391064	107 nt	BASIC	-0.74	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	MIR1468-201	ENST00000410600	86 nt	BASIC	-0.74	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNA5SP67-201	ENST00000516422	131 nt	BASIC	-0.74	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-895P-201	ENST00000384125	103 nt	BASIC	-0.75	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	SNORD114-17-201	ENST00000364699	75 nt	BASIC	-0.75	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-458P-201	ENST00000384179	107 nt	BASIC	-0.75	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-871P-201	ENST00000516122	100 nt	BASIC	-0.75	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNY1P9-201	ENST00000532431	109 nt	BASIC	-0.75	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	U6.58-201	ENST00000613107	107 nt	BASIC	-0.75	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	MIR548C-201	ENST00000384815	97 nt	BASIC	-0.76	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	MIR3681-201	ENST00000580089	72 nt	BASIC	-0.76	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	MIR4723-201	ENST00000585070	81 nt	BASIC	-0.76	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-776P-201	ENST00000364403	104 nt	BASIC	-0.77	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-1022P-201	ENST00000365049	104 nt	BASIC	-0.77	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	SNORD116-16-201	ENST00000384533	92 nt	BASIC	-0.77	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	SNORD116-24-201	ENST00000384549	92 nt	BASIC	-0.77	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	MIR601-201	ENST00000385256	79 nt	BASIC	-0.77	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-1296P-201	ENST00000383879	107 nt	BASIC	-0.78	□□□□□ -2.53
TAF1	P21675	RNU6-630P-201	ENST00000391258	106 nt	BASIC	-0.79	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	RNU6-1216P-201	ENST00000362590	107 nt	BASIC	-0.8	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	SCARNA17-201	ENST00000516183	144 nt	BASIC	-0.8	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	MIR198-201	ENST00000637333	62 nt	BASIC	-0.8	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	RNA5SP192-201	ENST00000364404	120 nt	BASIC	-0.8	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	SNORD83B-201	ENST00000386745	93 nt	BASIC	-0.8	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	RNU6-523P-201	ENST00000516304	54 nt	BASIC	-0.8	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	SNORA25.4-201	ENST00000363666	124 nt	BASIC	-0.81	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	Y_RNA.613-201	ENST00000410726	97 nt	BASIC	-0.81	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	MIR548AA1-201	ENST00000384971	97 nt	BASIC	-0.82	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	MIR889-201	ENST00000401280	79 nt	BASIC	-0.83	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	AL353691.2-201	ENST00000443795	59 nt	BASIC	-0.83	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	RNU6-539P-201	ENST00000516665	103 nt	BASIC	-0.83	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	MIR548AG1-201	ENST00000579932	66 nt	BASIC	-0.83	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	RNU6-92P-201	ENST00000605893	104 nt	BASIC	-0.84	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	SNORD30.1-201	ENST00000391309	70 nt	BASIC	-0.84	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	RNU7-151P-201	ENST00000516930	53 nt	BASIC	-0.84	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	AC005520.4-201	ENST00000604337	90 nt	BASIC	-0.84	□□□□□ -2.54
TAF1	P21675	SNORD115-33-201	ENST00000363723	82 nt	BASIC	-0.85	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	SNORD114-25-201	ENST00000363742	72 nt	BASIC	-0.85	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	MIR4306-201	ENST00000583390	91 nt	BASIC	-0.85	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	RNU6-540P-201	ENST00000384622	101 nt	BASIC	-0.86	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	RNU6-1238P-201	ENST00000517215	102 nt	BASIC	-0.86	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	SNORD60.1-201	ENST00000362451	73 nt	BASIC	-0.86	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	RNU6-471P-201	ENST00000383944	106 nt	BASIC	-0.86	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	SNORA41B-201	ENST00000384785	128 nt	BASIC	-0.86	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	SNORD64-201	ENST00000386683	67 nt	BASIC	-0.86	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	AP002795.1-201	ENST00000534879	84 nt	BASIC	-0.86	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	MIR378F-201	ENST00000578143	78 nt	BASIC	-0.87	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	MIR4511-201	ENST00000582784	87 nt	BASIC	-0.87	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	MIR548Q-201	ENST00000408404	100 nt	BASIC	-0.88	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	TRAJ9-201	ENST00000390528	61 nt	APPRIS P1 BASIC	-0.88	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	Y_RNA.583-201	ENST00000391033	113 nt	BASIC	-0.88	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	Y_RNA.514-201	ENST00000384528	112 nt	BASIC	-0.9	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	SNX3P1X-201	ENST00000414887	175 nt	BASIC	-0.9	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	SNORD1B-201	ENST00000363091	84 nt	BASIC	-0.9	□□□□□ -2.55
TAF1	P21675	RNU6-431P-201	ENST00000383874	107 nt	BASIC	-0.91	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	Y_RNA.443-201	ENST00000384135	111 nt	BASIC	-0.91	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	RNU6-649P-201	ENST00000384463	107 nt	BASIC	-0.91	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	SNORD19-201	ENST00000391191	68 nt	BASIC	-0.91	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	RNU6-1174P-201	ENST00000517278	101 nt	BASIC	-0.92	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	MIR3165-201	ENST00000579874	75 nt	BASIC	-0.92	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	U2.18-201	ENST00000622185	84 nt	BASIC	-0.92	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	RNU6-1233P-201	ENST00000362922	102 nt	BASIC	-0.93	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	Y_RNA.565-201	ENST00000384719	101 nt	BASIC	-0.93	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	TRAJ57-201	ENST00000390482	63 nt	APPRIS P1 BASIC	-0.93	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	RNU6-1236P-201	ENST00000517080	99 nt	BASIC	-0.94	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	MIR382-201	ENST00000637119	76 nt	BASIC	-0.94	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	RNU6-590P-201	ENST00000365039	107 nt	BASIC	-0.95	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	RNU6-10P-201	ENST00000384036	107 nt	BASIC	-0.95	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	SCARNA21.1-201	ENST00000515996	128 nt	BASIC	-0.96	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	MIR3938-201	ENST00000582157	103 nt	BASIC	-0.96	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	AC103706.3-201	ENST00000636297	85 nt	BASIC	-0.97	□□□□□ -2.56
TAF1	P21675	AC110620.1-201	ENST00000416042	228 nt	BASIC	-0.97	□□□□□ -2.57
TAF1	P21675	snoU83B.1-201	ENST00000517136	88 nt	BASIC	-0.97	□□□□□ -2.57
TAF1	P21675	MIR6738-201	ENST00000619620	64 nt	BASIC	-0.98	□□□□□ -2.57
TAF1	P21675	RNU6-706P-201	ENST00000517229	104 nt	BASIC	-0.99	□□□□□ -2.57
TAF1	P21675	MIR5683-201	ENST00000636514	76 nt	BASIC	-0.99	□□□□□ -2.57
TAF1	P21675	MIR507-201	ENST00000385234	94 nt	BASIC	-1	□□□□□ -2.57
TAF1	P21675	MIR4324-201	ENST00000584846	72 nt	BASIC	-1	□□□□□ -2.57
TAF1	P21675	ULK3-223	ENST00000631115	126 nt	TSL 5 BASIC	-1	□□□□□ -2.57
TAF1	P21675	RNU6-247P-201	ENST00000362636	107 nt	BASIC	-1.01	□□□□□ -2.57
TAF1	P21675	AC018880.2-201	ENST00000414265	201 nt	BASIC	-1.02	□□□□□ -2.57

Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.7 ms