Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
PTPRAP18433 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPRAP18433 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRAP18433 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRAP18433 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRAP18433 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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PTPRAP18433 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRAP18433 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRAP18433 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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PTPRAP18433 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRAP18433 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRAP18433 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PTPRAP18433 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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PTPRAP18433 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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PTPRAP18433 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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PTPRAP18433 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRAP18433 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PTPRAP18433 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRAP18433 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPRAP18433 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPRAP18433 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPRAP18433 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPRAP18433 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRAP18433 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPRAP18433 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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