Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.09□□□□□ -2.74
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TRAPPC13A5PLN9 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms