Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
TRIM4Q9C037 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
TRIM4Q9C037 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TRIM4Q9C037 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TRIM4Q9C037 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
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