Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
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SSX1Q16384 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
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SSX1Q16384 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
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SSX1Q16384 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
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SSX1Q16384 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
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SSX1Q16384 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
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SSX1Q16384 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
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SSX1Q16384 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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SSX1Q16384 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SSX1Q16384 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SSX1Q16384 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
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SSX1Q16384 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
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SSX1Q16384 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
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SSX1Q16384 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
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SSX1Q16384 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
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SSX1Q16384 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
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