Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SSX1Q16384 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
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SSX1Q16384 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SSX1Q16384 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
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SSX1Q16384 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
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SSX1Q16384 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SSX1Q16384 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
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SSX1Q16384 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
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SSX1Q16384 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
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SSX1Q16384 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
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SSX1Q16384 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SSX1Q16384 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SSX1Q16384 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SSX1Q16384 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
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SSX1Q16384 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SSX1Q16384 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
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SSX1Q16384 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
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SSX1Q16384 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SSX1Q16384 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
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SSX1Q16384 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
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SSX1Q16384 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
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SSX1Q16384 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
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SSX1Q16384 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SSX1Q16384 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
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