Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1SQ13698 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CACNA1SQ13698 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
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