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Protein–RNA interactions for Protein: Q13616
CUL1, Cullin-1, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL1
Q13616
RNU6-1154P-201
ENST00000391001
104 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
RNU6-313P-201
ENST00000516317
112 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
RNA5SP67-201
ENST00000516422
131 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
MIR4770-201
ENST00000579149
58 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
MIR6502-201
ENST00000617296
76 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
SNORA40.13-201
ENST00000516379
120 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
RNU6-1238P-201
ENST00000517215
102 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
MALAT1.1-201
ENST00000618249
95 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
CUL1
Q13616
MIR409-201
ENST00000362237
79 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
RNU6-755P-201
ENST00000364400
103 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
RNY4P18-201
ENST00000391107
89 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
AC074348.1-201
ENST00000426503
132 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
MIR548AG1-201
ENST00000579932
66 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
MIR4520-1-201
ENST00000582609
70 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
MIR450A1-201
ENST00000362262
91 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
SNORD113-1-201
ENST00000365321
69 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
MIR3675-201
ENST00000583661
73 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
RNU6-686P-201
ENST00000364839
107 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
MIR507-201
ENST00000385234
94 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
AC091912.2-201
ENST00000624798
167 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
HAR1A.1-201
ENST00000459583
118 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
RNU7-174P-201
ENST00000516248
59 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
MIR548BB-201
ENST00000626714
66 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
MIR6874-201
ENST00000635894
71 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
MIRLET7A1-201
ENST00000362295
80 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
SNORA8.1-201
ENST00000384250
140 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
SNORD57-201
ENST00000448188
72 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
U7.5-201
ENST00000517224
61 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
AP002795.1-201
ENST00000534879
84 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL1
Q13616
RNU6-1216P-201
ENST00000362590
107 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-164P-201
ENST00000364604
103 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-675P-201
ENST00000384236
104 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-402P-201
ENST00000410678
103 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
MIR3910-1-201
ENST00000580936
111 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-330P-201
ENST00000363015
107 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNA5SP180-201
ENST00000516181
101 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNA5SP86-201
ENST00000390869
98 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
SNORD19-201
ENST00000391191
68 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-1174P-201
ENST00000517278
101 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
Y_RNA.74-201
ENST00000362911
99 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-478P-201
ENST00000363904
110 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-1325P-201
ENST00000364905
105 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
Y_RNA.468-201
ENST00000384298
102 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-129P-201
ENST00000391022
107 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-1089P-201
ENST00000516473
104 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-267P-201
ENST00000516714
103 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
MIR5683-201
ENST00000636514
76 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
MIR1297-201
ENST00000637311
77 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
Y_RNA.532-201
ENST00000384590
113 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-604P-201
ENST00000390917
100 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU7-88P-201
ENST00000458752
63 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
MIR4490-201
ENST00000582647
84 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
Y_RNA.232-201
ENST00000364369
96 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
Y_RNA.629-201
ENST00000411368
105 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
MIR1246-201
ENST00000636535
73 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
CUL1
Q13616
RNU6-640P-201
ENST00000363693
105 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-32P-201
ENST00000383948
107 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-458P-201
ENST00000384179
107 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-13P-201
ENST00000384248
107 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-12P-201
ENST00000384604
107 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-41P-201
ENST00000384741
107 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-587P-201
ENST00000391282
106 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RPL35AP4-201
ENST00000412007
102 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
U6.58-201
ENST00000613107
107 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-540P-201
ENST00000384622
101 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
MIR548C-201
ENST00000384815
97 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNA5SP266-201
ENST00000410273
108 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
MIR429-201
ENST00000362106
83 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-698P-201
ENST00000363523
107 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-34P-201
ENST00000364874
107 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
MIR488-201
ENST00000365739
83 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
Y_RNA.442-201
ENST00000384131
102 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
Y_RNA.611-201
ENST00000410682
108 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
AC090616.4-201
ENST00000448026
115 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
AC006160.2-201
ENST00000637708
154 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-696P-201
ENST00000390834
107 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-982P-201
ENST00000516216
102 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-844P-201
ENST00000517175
102 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
SNORD45.1-201
ENST00000363181
77 nt
BASIC
-1.7
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
Y_RNA.181-201
ENST00000363872
101 nt
BASIC
-1.7
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
Y_RNA.236-201
ENST00000364427
111 nt
BASIC
-1.7
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
Y_RNA.282-201
ENST00000364793
102 nt
BASIC
-1.7
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-380P-201
ENST00000410207
107 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-168P-201
ENST00000516189
101 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
MIR548H1-201
ENST00000408610
102 nt
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
U4.4-201
ENST00000620626
117 nt
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
CUL1
Q13616
RNU6-315P-201
ENST00000362666
107 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
Y_RNA.325-201
ENST00000365171
122 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
Y_RNA.426-201
ENST00000384068
113 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
Y_RNA.607-201
ENST00000410597
98 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
MTND4LP1-201
ENST00000446263
157 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
MIR8053-201
ENST00000613344
75 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
RNA5SP215-201
ENST00000363440
122 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
SNORD18.1-201
ENST00000363807
70 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
RNU6-147P-201
ENST00000383983
107 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
Y_RNA.219-201
ENST00000364232
113 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
RNU6-215P-201
ENST00000365169
102 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
MIR548Q-201
ENST00000408404
100 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
RNU6-983P-201
ENST00000516004
103 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
CUL1
Q13616
MIR548V-201
ENST00000584165
80 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
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