Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEMA3FQ13275 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3FQ13275 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3FQ13275 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3FQ13275 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3FQ13275 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3FQ13275 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3FQ13275 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3FQ13275 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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SEMA3FQ13275 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
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SEMA3FQ13275 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SEMA3FQ13275 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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SEMA3FQ13275 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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SEMA3FQ13275 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3FQ13275 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3FQ13275 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3FQ13275 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3FQ13275 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3FQ13275 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3FQ13275 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SEMA3FQ13275 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SEMA3FQ13275 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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