Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TSPAN31Q12999 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TSPAN31Q12999 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TSPAN31Q12999 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TSPAN31Q12999 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TSPAN31Q12999 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TSPAN31Q12999 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TSPAN31Q12999 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TSPAN31Q12999 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TSPAN31Q12999 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TSPAN31Q12999 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.87□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TSPAN31Q12999 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
TSPAN31Q12999 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TSPAN31Q12999 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TSPAN31Q12999 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
TSPAN31Q12999 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292 ms