Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
SNRPFP62306 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
SNRPFP62306 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
SNRPFP62306 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
SNRPFP62306 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
SNRPFP62306 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
SNRPFP62306 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
SNRPFP62306 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
SNRPFP62306 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
SNRPFP62306 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
SNRPFP62306 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-5.32□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-5.34□□□□□ -3.26
SNRPFP62306 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-5.39□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-5.39□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-5.4□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
SNRPFP62306 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
SNRPFP62306 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-5.47□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-5.51□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.29
SNRPFP62306 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
SNRPFP62306 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
SNRPFP62306 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
SNRPFP62306 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
SNRPFP62306 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
SNRPFP62306 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
SNRPFP62306 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-5.58□□□□□ -3.3
SNRPFP62306 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
SNRPFP62306 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
SNRPFP62306 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-5.6□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-5.62□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-5.62□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
SNRPFP62306 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.5 ms