Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TMOD1P28289 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TMOD1P28289 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
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TMOD1P28289 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
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TMOD1P28289 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
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TMOD1P28289 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
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TMOD1P28289 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TMOD1P28289 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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TMOD1P28289 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMOD1P28289 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TMOD1P28289 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
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