Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
J3QKU1 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
J3QKU1 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
J3QKU1 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
J3QKU1 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
J3QKU1 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
J3QKU1 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
J3QKU1 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
J3QKU1 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
J3QKU1 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
J3QKU1 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
J3QKU1 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
J3QKU1 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
J3QKU1 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
J3QKU1 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
J3QKU1 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
J3QKU1 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
J3QKU1 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
J3QKU1 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
J3QKU1 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
J3QKU1 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
J3QKU1 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
J3QKU1 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
J3QKU1 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
J3QKU1 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
J3QKU1 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
J3QKU1 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
J3QKU1 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
J3QKU1 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
J3QKU1 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
J3QKU1 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
J3QKU1 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
J3QKU1 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
J3QKU1 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
J3QKU1 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
J3QKU1 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
J3QKU1 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
J3QKU1 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
J3QKU1 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
J3QKU1 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
J3QKU1 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
J3QKU1 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
J3QKU1 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
J3QKU1 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
J3QKU1 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
J3QKU1 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
J3QKU1 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
J3QKU1 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
J3QKU1 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
J3QKU1 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
J3QKU1 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
J3QKU1 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
J3QKU1 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
J3QKU1 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
J3QKU1 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
J3QKU1 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
J3QKU1 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
J3QKU1 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
J3QKU1 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
J3QKU1 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
J3QKU1 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
J3QKU1 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
J3QKU1 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
J3QKU1 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
J3QKU1 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
J3QKU1 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
J3QKU1 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
J3QKU1 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
J3QKU1 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
J3QKU1 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
J3QKU1 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
J3QKU1 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
J3QKU1 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
J3QKU1 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
J3QKU1 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
J3QKU1 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
J3QKU1 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
J3QKU1 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
J3QKU1 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
J3QKU1 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
J3QKU1 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
J3QKU1 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms