Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

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Length 1,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLIP2Q9UDT6 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLIP2Q9UDT6 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CLIP2Q9UDT6 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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CLIP2Q9UDT6 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
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CLIP2Q9UDT6 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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CLIP2Q9UDT6 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CLIP2Q9UDT6 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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CLIP2Q9UDT6 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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CLIP2Q9UDT6 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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CLIP2Q9UDT6 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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CLIP2Q9UDT6 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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CLIP2Q9UDT6 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLIP2Q9UDT6 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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