Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SPOCK3Q9BQ16 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SPOCK3Q9BQ16 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SPOCK3Q9BQ16 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
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