Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CCDC47Q96A33 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-2.06□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
CCDC47Q96A33 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
CCDC47Q96A33 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CCDC47Q96A33 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CCDC47Q96A33 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
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