Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
ARHGEF28Q8N1W1 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.55□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
ARHGEF28Q8N1W1 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ARHGEF28Q8N1W1 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms