Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
NFIL3Q16649 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NFIL3Q16649 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
NFIL3Q16649 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
NFIL3Q16649 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NFIL3Q16649 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
NFIL3Q16649 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NFIL3Q16649 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
NFIL3Q16649 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276.2 ms