Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
SMN1Q16637 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SMN1Q16637 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SMN1Q16637 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SMN1Q16637 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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