Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SHHQ15465 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHHQ15465 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHHQ15465 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHHQ15465 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHHQ15465 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SHHQ15465 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHHQ15465 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHHQ15465 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHHQ15465 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHHQ15465 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHHQ15465 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHHQ15465 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHHQ15465 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHHQ15465 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHHQ15465 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHHQ15465 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHHQ15465 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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SHHQ15465 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SHHQ15465 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SHHQ15465 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SHHQ15465 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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SHHQ15465 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHHQ15465 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHHQ15465 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHHQ15465 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHHQ15465 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHHQ15465 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHHQ15465 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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