Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
EEA1Q15075 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-4.9□□□□□ -3.19
EEA1Q15075 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-4.91□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-4.91□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-4.91□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-4.91□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-4.91□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-4.92□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-4.93□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-4.93□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-4.93□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-4.93□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-4.94□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-4.95□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-4.96□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.2
EEA1Q15075 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-4.97□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-4.98□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-4.98□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.99□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-4.99□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-5□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-5.01□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-5.02□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-5.02□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-5.03□□□□□ -3.21
EEA1Q15075 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-5.04□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-5.04□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-5.05□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-5.05□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-5.06□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-5.07□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-5.08□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-5.09□□□□□ -3.22
EEA1Q15075 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-5.1□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-5.1□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-5.11□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-5.11□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-5.12□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-5.13□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
EEA1Q15075 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-5.14□□□□□ -3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.3 ms