Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TNFAIP1Q13829 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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TNFAIP1Q13829 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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TNFAIP1Q13829 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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TNFAIP1Q13829 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TNFAIP1Q13829 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TNFAIP1Q13829 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TNFAIP1Q13829 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TNFAIP1Q13829 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TNFAIP1Q13829 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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TNFAIP1Q13829 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TNFAIP1Q13829 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
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TNFAIP1Q13829 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
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TNFAIP1Q13829 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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TNFAIP1Q13829 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
TNFAIP1Q13829 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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TNFAIP1Q13829 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNFAIP1Q13829 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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TNFAIP1Q13829 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNFAIP1Q13829 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNFAIP1Q13829 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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TNFAIP1Q13829 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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TNFAIP1Q13829 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNFAIP1Q13829 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNFAIP1Q13829 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNFAIP1Q13829 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNFAIP1Q13829 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNFAIP1Q13829 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNFAIP1Q13829 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNFAIP1Q13829 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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