Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-5.75□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-5.77□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-5.77□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-5.78□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-5.78□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-5.78□□□□□ -3.33
TFF3Q07654 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-5.79□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-5.84□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-5.84□□□□□ -3.34
TFF3Q07654 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-5.86□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-5.87□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-5.87□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-5.87□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-5.87□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-5.88□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-5.88□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-5.89□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-5.89□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-5.89□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
TFF3Q07654 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-5.91□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-5.91□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-5.92□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-5.93□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-5.93□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-5.93□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-5.93□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-5.93□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-5.93□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-5.94□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-5.95□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-5.95□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-5.96□□□□□ -3.36
TFF3Q07654 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-5.97□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-5.97□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-5.97□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-5.98□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-5.98□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-5.98□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-5.99□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-6□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-6□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-6□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-6□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-6.01□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-6.01□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-6.01□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-6.01□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-6.02□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-6.02□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-6.02□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-6.02□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-6.03□□□□□ -3.37
TFF3Q07654 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-6.04□□□□□ -3.38
TFF3Q07654 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-6.04□□□□□ -3.38
TFF3Q07654 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-6.04□□□□□ -3.38
TFF3Q07654 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-6.04□□□□□ -3.38
TFF3Q07654 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-6.04□□□□□ -3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms