Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
VPREB1P12018 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
VPREB1P12018 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
VPREB1P12018 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
VPREB1P12018 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 340.4 ms