Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT8

ZC3H4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H4Q9UPT8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC3H4Q9UPT8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms