Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed2Q9R0Q3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms