Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCC12Q96J65 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCC12Q96J65 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms